Kiedy Lotte strzela do Maxine, ta ucieka przez drzwi. Kula trafia w ścianę na lewo od drzwi. Jednak kiedy spojrzymy na prawą stronę, widzimy tam także miejsce po kuli, jednak nie słyszeliśmy wcześniejszego wystrzału.
Kiedy Craig i Dr Lester siedzą w jego gabinecie, cień mikrofonu odbija się na okiennej framudze, która jest między nimi.
Kiedy Maxine pierwszy raz odwiedza Johna w jego mieszkaniu, na podłodze można dostrzec cień mikrofonu.
Gdy Craig odkrywa portal, zegar wskazuje 2:23. Jednak kiedy powraca z głowy Johna Malkovicha po paru minutach, nadal jest ta sama godzina.
Gdy Craig znajduje się w biurze Maxine, na klamce wisi płaszcz. Jednak kiedy chwilę później od niej wychodzi, płaszcz znika z klamki.
Kiedy Craig wchodzi do windy po raz pierwszy, alarm przestaje dzwonić, zanim drzwi się zamykają. Jednak kiedy Maxine jest w windzie, alarm nadal dzwoni, gdy drzwi są zamknięte.
Wypuszczony z klatki Elijah wskakuje na łóżko i demoluje je. Jednak w następnym ujęciu, na łóżku nie ma śladu po bałaganie, który zostawił szympans.
Podczas rozmowy Craiga z Lesterem, rany z ust tego pierwszego zmieniają miejsce, aż w końcu całkowicie znikają.
Kiedy Craig ma wejść do portalu, klęczy. Jednak w kolejnym ujęciu, mężczyzna kuca.
Szympans Eliah, raz ma białą brodę, a raz nie.
Kiedy Craig ma odkryć portal, podnosi dokumenty i kładzie je na biurku. Jednak w kolejnej scenie, nie leżą tam papiery, które mężczyzna przed chwilą położył.
Gdy ludzie wypadają z portalu, samochody, które stoją na autostradzie, zmieniają pozycje.
W scenie, kiedy John i Maxine całują się na kanapie, ramiączko od sukienki kobiety, w jednym ujęciu spada, w innym- nie.
Kiedy Maxine i Lotte są w szkolnym autobusie, można zauważyć jak członek ekipy filmowej przytrzymuje spódnicę pierwszej, by nie wypadła z pojazdu.
Kiedy Maxine wlatuje przez szafę do sypialni Johna, obok komody można zobaczyć ubranego w zieloną koszulę członka ekipy filmowej.
Chociaż akcja filmu toczy się w Nowym Jorku, podczas rozmowy Craiga i Lestera w restauracji, można dostrzec dwa pomarańczowe autobusy, charakterystyczne dla miejskiej komunikacji w Los Angeles.
Kiedy Maxine wchodzi do widny, ktoś z zewnątrz naciska przycisk, by ją zatrzymać. Jednak jest to niemożliwe, gdyż zatrzymać windę, może jedynie osoba, która się w niej znajduje.
Zdjęcia do filmu zrealizowano w hotelu Ambasador Los Angeles, Long Beach i Pasadenie (Kalifornia, USA) oraz w Jersey City (New Jersey, USA).
Craig dowiaduje się że LesterCorp znajduje się na 7 i pół piętrze biurowca Mertin Flemmer widząc napis "7 1/2" na tabliczce w holu dokładnie w 7 i pół minucie filmu.
W scenie, gdzie Craig próbuje odgadnąć imię Maxime, jednym z imion, które wymienia jest Emily, późniejsza córka Maxime. Imiona, które wymawia w tej scenie są aluzją do doktora Lestera i grupy jego przyjaciół.
Sztuka, którą Craig przedstawia na ulicy (kiedy zostaje uderzony przez wściekłego ojca dziewczynki) jest oparta na listach Abelarda i Heloizy napisanych pomiędzy 1115 i 1117 r. Motyw tej pary kochanków, symbolu nieszczęśliwej miłości był wykorzystywany przez wielu artystów, m.in. przez Williama Szekspira w "Romeo i Julii".
W filmie John Malkovich ma na drugie imię Horatio, jednak w rzeczywistości ma na imię Gavin.
Zdjęcia do filmu kręcono od 20 lipca do 18 września 1998 roku.